More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3150 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3150  response regulator receiver protein  100 
 
 		 152 aa  309  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2751  response regulator receiver domain-containing protein  46.61 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301483  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 1977 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 397 aa  100  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 		 1362 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 		 1274 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  44.8 
 
 		 1361 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 392 aa  98.2  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  44.23 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  42.61 
 
 		 1361 aa  97.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  45.13 
 
 		 461 aa  96.3  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  45.13 
 
 		 456 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 1352 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 229 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.55 
 
 		 222 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  45.1 
 
 		 125 aa  95.5  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.16 
 
 		 230 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 		 303 aa  93.6  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 309 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 391 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  37.8 
 
 		 312 aa  91.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 127 aa  91.7  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  37.3 
 
 		 556 aa  91.7  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  40.38 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 333 aa  90.9  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  40.95 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 395 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 935 aa  90.5  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 227 aa  90.5  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.59 
 
 		 231 aa  90.1  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 437 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 2099 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 503 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 381 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4896  response regulator receiver domain-containing protein  34.96 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645531  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.35 
 
 		 457 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 391 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 454 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  41.07 
 
 		 548 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 353 aa  90.1  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  36.07 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  40.38 
 
 		 1695 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 437 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 440 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.95 
 
 		 385 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 309 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  42.72 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1058 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  41.75 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 500 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0960  histidine kinase  41.67 
 
 		 258 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  40.38 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  38.39 
 
 		 1111 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  34.09 
 
 		 309 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2781  two component transcriptional regulator  34.35 
 
 		 241 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 2099 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 945 aa  87.8  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 200 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 441 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 236 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.01 
 
 		 305 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 566 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1839 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  43.43 
 
 		 466 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 1185 aa  87.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1322 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3382  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.29 
 
 		 594 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.371129 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  39.81 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  39.42 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  36.7 
 
 		 272 aa  87.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  39.81 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  41.35 
 
 		 457 aa  87  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4099  histidine kinase  35.25 
 
 		 600 aa  86.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  decreased coverage  0.000691518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2477  response regulator receiver protein  44.68 
 
 		 124 aa  87  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.586597  normal  0.458637 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  40.19 
 
 		 896 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  40.19 
 
 		 896 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 407 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  37.93 
 
 		 1127 aa  86.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 1002 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.22 
 
 		 305 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  39.17 
 
 		 337 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1857 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>