More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1534 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  100 
 
 		 121 aa  243  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  61.4 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  60.53 
 
 		 121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  60.53 
 
 		 121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  61.4 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  60.53 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  59.65 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  60.53 
 
 		 121 aa  146  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  57.89 
 
 		 129 aa  143  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  51.79 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  48.25 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 121 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  46.85 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1570  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  38.53 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  33.04 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  35.96 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2212  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2370  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 1974 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  36.36 
 
 		 2284 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 633 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 378 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 245 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.79 
 
 		 711 aa  67  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1846  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.93 
 
 		 314 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  31.86 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3528  two component response regulator  29.2 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 1907 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3080  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.425562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3337  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  35.54 
 
 		 2301 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.09 
 
 		 2336 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2008  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 404 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 248 aa  63.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  33.98 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  37.63 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0692  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.370043  unclonable  0.00000000838432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  32.46 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 974 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0515999 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  37.63 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  35.92 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  37.63 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 574 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  36.84 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  38.46 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  33.33 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.41 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.91 
 
 		 423 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  32.71 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  38.46 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.46 
 
 		 249 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.09 
 
 		 229 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 245 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 301 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  34.75 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  30.25 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>