More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0953 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  100 
 
 
119 aa  237  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  93.28 
 
 
119 aa  223  5.0000000000000005e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  76.32 
 
 
118 aa  176  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  68.97 
 
 
120 aa  169  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  68.1 
 
 
120 aa  165  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  69.3 
 
 
118 aa  164  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  55 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  53.33 
 
 
120 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  53.33 
 
 
120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  50.85 
 
 
123 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  51.67 
 
 
120 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  50 
 
 
123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  52.5 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  52.54 
 
 
123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  50.85 
 
 
123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  50.88 
 
 
117 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  49.15 
 
 
118 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  50.85 
 
 
119 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  50 
 
 
118 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  59 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  48.28 
 
 
120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  50.43 
 
 
117 aa  117  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  47.41 
 
 
122 aa  117  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  45.69 
 
 
120 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  47.37 
 
 
119 aa  116  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  48.7 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
122 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  43.1 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  50 
 
 
120 aa  114  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  46.55 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  46.55 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  46.55 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  45.69 
 
 
122 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  48.67 
 
 
120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
119 aa  110  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
120 aa  110  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  45.76 
 
 
122 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  43.86 
 
 
119 aa  110  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  46.55 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  44.74 
 
 
119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  46.9 
 
 
120 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  44.07 
 
 
119 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
120 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  44.07 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
120 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  46.9 
 
 
120 aa  107  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  44.35 
 
 
120 aa  107  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  44.25 
 
 
120 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  48.31 
 
 
120 aa  106  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  43.1 
 
 
144 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  42.02 
 
 
122 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
122 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  41.18 
 
 
122 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  41.18 
 
 
122 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  41.18 
 
 
122 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  41.18 
 
 
122 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  41.18 
 
 
122 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  41.03 
 
 
121 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  41.18 
 
 
122 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  41.18 
 
 
122 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  41.18 
 
 
122 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  45.22 
 
 
122 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
121 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  43.48 
 
 
121 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 
120 aa  100  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  41.88 
 
 
117 aa  100  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3041  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 
125 aa  98.6  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.605756  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  39.17 
 
 
234 aa  98.6  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
123 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  42.02 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  41.88 
 
 
123 aa  97.1  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  42.11 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3195  response regulator receiver protein  39.17 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
229 aa  93.6  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  47.37 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  50.49 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.22 
 
 
222 aa  92  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 
217 aa  91.3  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
217 aa  91.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
1066 aa  90.9  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
117 aa  90.9  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
119 aa  90.5  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
216 aa  90.1  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
214 aa  90.1  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.02 
 
 
205 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  39.83 
 
 
266 aa  89.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
120 aa  89  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02970  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.38 
 
 
227 aa  88.6  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.611463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
232 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.44 
 
 
212 aa  87.8  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  45.69 
 
 
234 aa  87.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.36 
 
 
218 aa  87.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
915 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 
228 aa  87  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
221 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 
231 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  46.02 
 
 
206 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>