More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0479 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  85.83 
 
 		 120 aa  211  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  84.17 
 
 		 120 aa  208  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  78.99 
 
 		 120 aa  193  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  77.31 
 
 		 120 aa  191  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  73.33 
 
 		 120 aa  189  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  73.33 
 
 		 120 aa  186  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  71.67 
 
 		 120 aa  186  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  73.5 
 
 		 119 aa  186  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  72.65 
 
 		 119 aa  185  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  72.5 
 
 		 120 aa  185  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  74.58 
 
 		 120 aa  183  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  74.58 
 
 		 120 aa  183  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  72.27 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  69.17 
 
 		 121 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  73.91 
 
 		 119 aa  180  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  72.03 
 
 		 119 aa  178  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  70 
 
 		 120 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  70.69 
 
 		 119 aa  178  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  70 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  70.59 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  65 
 
 		 122 aa  167  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  71.55 
 
 		 119 aa  167  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  65.55 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  63.03 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  63.03 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  63.03 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  63.03 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  62.18 
 
 		 122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  62.18 
 
 		 122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  62.18 
 
 		 122 aa  160  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  62.18 
 
 		 122 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  62.18 
 
 		 122 aa  159  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 144 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  64.66 
 
 		 117 aa  157  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  62.5 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  62.5 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  62.5 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  60.83 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  58.62 
 
 		 119 aa  151  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  61.21 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  52.99 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  53.85 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  57.76 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  54.78 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  53.39 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  56.03 
 
 		 117 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  54.31 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  51.69 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 123 aa  126  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  49.14 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  47.83 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  47.46 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 123 aa  117  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 123 aa  116  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 234 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  44.25 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  44.35 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3041  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.605756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  43.7 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  41.88 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 1066 aa  103  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  44.83 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0161  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0170  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000628912  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 225 aa  92.8  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.9 
 
 		 350 aa  92  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.241681  normal  0.456966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2935  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00116443  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 214 aa  92  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.66 
 
 		 205 aa  90.5  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 127 aa  90.5  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  40.17 
 
 		 216 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0315  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.48267  normal  0.327834 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3857  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1380  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>