More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1380 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1380  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 1066 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  46.15 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  46.15 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  46.15 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  46.15 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  46.15 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  46.15 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  46.15 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  47.57 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  46.15 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  46.15 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  38.79 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  43.64 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  45.79 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  43.52 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 120 aa  93.6  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 119 aa  93.6  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  40.74 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3740  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 119 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 120 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.76 
 
 		 450 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.468423  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  32.46 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  36.11 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  42.86 
 
 		 344 aa  85.9  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  42.86 
 
 		 344 aa  85.9  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  38.32 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.86 
 
 		 353 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.04 
 
 		 353 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  42.72 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1729  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.23 
 
 		 366 aa  84.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  34.78 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0173  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.12 
 
 		 366 aa  83.6  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0415751  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2935  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00116443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1311  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.99 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.436181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0762  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.9 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0733  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.2 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.549181  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0170  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000628912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0880  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40 
 
 		 358 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.53 
 
 		 457 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1571  response regulator receiver domain-containing protein  43.93 
 
 		 369 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.421164  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1013  protein-glutamate methylesterase CheB  42.31 
 
 		 358 aa  80.5  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  40 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2262  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.12 
 
 		 379 aa  80.5  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00869886 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2891  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0219  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.12 
 
 		 362 aa  80.1  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3303  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.1 
 
 		 366 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.919259 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3195  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.45 
 
 		 454 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3945  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.67 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2235  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.86 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 508 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0561  CheY  35.4 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0997378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.28 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0576  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.1 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.630025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>