More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0811 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  100 
 
 		 117 aa  236  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  65.52 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  60.87 
 
 		 120 aa  148  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  58.97 
 
 		 117 aa  147  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  60.34 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  63.48 
 
 		 120 aa  147  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  62.93 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  58.62 
 
 		 123 aa  144  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  61.54 
 
 		 119 aa  144  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  57.76 
 
 		 121 aa  143  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  58.62 
 
 		 119 aa  143  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  61.21 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  60.53 
 
 		 120 aa  143  9e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  56.9 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  61.21 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  57.76 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  58.12 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  56.9 
 
 		 119 aa  138  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  57.76 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  60 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  56.03 
 
 		 120 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  57.39 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  56.41 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  57.89 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  56.9 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  56.9 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  56.41 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  57.26 
 
 		 119 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  54.39 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  56.9 
 
 		 122 aa  129  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  51.28 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  56.9 
 
 		 122 aa  129  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  56.9 
 
 		 122 aa  129  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  56.9 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  52.59 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  56.9 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  56.9 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  56.9 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  56.9 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  56.9 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  56.9 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  56.9 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  53.45 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  52.14 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  46.55 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 234 aa  118  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  51.72 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  50.86 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 122 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  53.45 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  52.25 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  47.86 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 118 aa  115  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  51.35 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  49.12 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  50 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  48.62 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  50.89 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  45.3 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  46.49 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 214 aa  99  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  43.36 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0692  CheY  44.74 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0775756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 231 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.13 
 
 		 205 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  42.98 
 
 		 130 aa  94.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 120 aa  94  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 1066 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.61 
 
 		 227 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 417 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.71 
 
 		 218 aa  87.8  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4359  ATPase domain-containing protein  36.21 
 
 		 494 aa  87.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.47 
 
 		 214 aa  87.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.59 
 
 		 200 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 229 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 221 aa  87  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  40.71 
 
 		 207 aa  87  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0170  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000628912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3321  chemotaxis protein  38.74 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.628271  normal  0.0214541 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 218 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>