More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2561 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  100 
 
 		 118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  78.07 
 
 		 119 aa  180  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  76.32 
 
 		 119 aa  176  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  64.91 
 
 		 120 aa  161  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  62.71 
 
 		 120 aa  160  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  69.64 
 
 		 118 aa  158  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  55.86 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  54.95 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  56.25 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  52.17 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 122 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  55.86 
 
 		 123 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  57.66 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  56.9 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  54.46 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  56.73 
 
 		 119 aa  125  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  54.46 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  55.36 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  50 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  49.58 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  45.69 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  45.69 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  45.69 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  45.69 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  45.69 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  45.69 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  45.69 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  45.69 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  44.83 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  50.44 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  52.21 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  46.96 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  50 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  47.32 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  50.89 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  44.25 
 
 		 121 aa  106  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  45.22 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  55.66 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 234 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  44.07 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  53.77 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 214 aa  97.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3041  response regulator receiver domain-containing protein  45.05 
 
 		 125 aa  97.4  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.605756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  47.46 
 
 		 206 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 217 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.02 
 
 		 217 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 216 aa  94.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 230 aa  93.6  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 234 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.76 
 
 		 224 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  44.14 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 214 aa  92  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 119 aa  91.7  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 1066 aa  90.9  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 241 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.02 
 
 		 236 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 232 aa  90.5  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.48 
 
 		 222 aa  90.1  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0157  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 221 aa  89.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  45.69 
 
 		 205 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 229 aa  88.2  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 219 aa  88.2  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>