More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1556 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  250  5.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 118 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  45.22 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 119 aa  113  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  45.3 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  50 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 120 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  47.83 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 117 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 119 aa  107  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 234 aa  101  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  45.1 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 1066 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  42.11 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  42.4 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 123 aa  97.1  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  40.32 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3041  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.605756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  40.87 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  40.87 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  39 
 
 		 212 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  41.32 
 
 		 215 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  40.87 
 
 		 122 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  40.87 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  40.35 
 
 		 121 aa  94  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  40.87 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  40 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  40 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  40 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  40 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  40 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 216 aa  91.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 218 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 223 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 214 aa  91.3  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  37.93 
 
 		 216 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  43.59 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 222 aa  90.5  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 264 aa  90.5  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  40.17 
 
 		 212 aa  90.1  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 216 aa  90.1  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.34 
 
 		 224 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 234 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 234 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  39.69 
 
 		 242 aa  88.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 220 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0851  two component LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 216 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0778308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 213 aa  88.6  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2713  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 208 aa  88.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 231 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 216 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 217 aa  88.2  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.18 
 
 		 366 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.44 
 
 		 225 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>