More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2701 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  243  9e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  79.17 
 
 		 120 aa  202  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  74.17 
 
 		 120 aa  191  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  75 
 
 		 119 aa  189  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  73.33 
 
 		 120 aa  189  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  75.63 
 
 		 120 aa  188  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  74.14 
 
 		 119 aa  187  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  73.11 
 
 		 120 aa  186  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 121 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  73.33 
 
 		 120 aa  185  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  73.28 
 
 		 119 aa  184  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  71.67 
 
 		 120 aa  184  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  71.67 
 
 		 120 aa  183  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  71.43 
 
 		 122 aa  183  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  73.5 
 
 		 119 aa  182  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  73.11 
 
 		 119 aa  181  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  71.43 
 
 		 120 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  70.94 
 
 		 120 aa  176  9e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  70.94 
 
 		 120 aa  176  9e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  68.07 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  68.07 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  73.45 
 
 		 119 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  68.38 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  64.71 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  59.13 
 
 		 119 aa  157  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  61.02 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  61.02 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  61.02 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  61.02 
 
 		 122 aa  156  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  61.02 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  61.02 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  61.86 
 
 		 144 aa  156  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  61.02 
 
 		 122 aa  156  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  61.02 
 
 		 122 aa  156  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  61.02 
 
 		 122 aa  156  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  61.02 
 
 		 122 aa  156  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  62.61 
 
 		 117 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  59.65 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  61.54 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  57.5 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  57.76 
 
 		 120 aa  143  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  55.17 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  54.87 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  57.39 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  53.91 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  52.59 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  51.33 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  53.45 
 
 		 123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  50 
 
 		 234 aa  124  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  47.83 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 123 aa  123  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  47.01 
 
 		 121 aa  120  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  46.49 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 119 aa  117  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  47.32 
 
 		 118 aa  116  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  46.55 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 123 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 120 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  46.02 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3041  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.605756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  45.76 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  43.59 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  38.26 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 1066 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.86 
 
 		 462 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 214 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 122 aa  94.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 130 aa  94  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.96 
 
 		 224 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0315  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.48267  normal  0.327834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0692  CheY  42.11 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0775756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 455 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 227 aa  90.5  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1777  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 465 aa  90.5  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 218 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3321  chemotaxis protein  40 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.628271  normal  0.0214541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>