More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0722 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  100 
 
 
121 aa  244  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  67.24 
 
 
122 aa  174  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  66.96 
 
 
121 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  67.23 
 
 
121 aa  155  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  65.55 
 
 
121 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  54.7 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  55 
 
 
120 aa  138  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  53.85 
 
 
119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  53.85 
 
 
122 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  53.85 
 
 
122 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  53.85 
 
 
122 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  52.99 
 
 
119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  53.45 
 
 
120 aa  134  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  53.45 
 
 
120 aa  134  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  53.39 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  52.5 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  53.04 
 
 
119 aa  131  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  50.43 
 
 
120 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  49.15 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  49.15 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  49.15 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  49.15 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  50.88 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  51.75 
 
 
120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  48.31 
 
 
122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  48.31 
 
 
122 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  48.31 
 
 
122 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  48.31 
 
 
122 aa  127  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  50.88 
 
 
119 aa  127  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  48.31 
 
 
122 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  48.31 
 
 
122 aa  127  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  50.88 
 
 
120 aa  127  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  48.31 
 
 
122 aa  127  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  50 
 
 
119 aa  127  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  47.46 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  48.72 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  50.43 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  48.72 
 
 
120 aa  124  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
122 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  49.57 
 
 
122 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  47.01 
 
 
120 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  47.41 
 
 
120 aa  120  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  54.7 
 
 
122 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
121 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  48.72 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  47.37 
 
 
120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  49.57 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  49.57 
 
 
119 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  49.57 
 
 
117 aa  116  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  49.14 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  49.57 
 
 
117 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2935  response regulator receiver protein  47.86 
 
 
125 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00116443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  49.57 
 
 
118 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  47.01 
 
 
125 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  47.01 
 
 
120 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  49.17 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  49.15 
 
 
118 aa  111  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
117 aa  110  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  49.12 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  44.17 
 
 
120 aa  106  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3090  response regulator receiver protein  54.05 
 
 
120 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.820177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  40.68 
 
 
123 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
118 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  43.1 
 
 
1066 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  45.61 
 
 
119 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
119 aa  104  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
120 aa  104  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  43.1 
 
 
125 aa  100  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
234 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2886  response regulator receiver protein  44.35 
 
 
125 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8267e-27 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  40.68 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0692  CheY  44.63 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0775756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3195  response regulator receiver protein  42.98 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  45.19 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  41.88 
 
 
123 aa  92  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  40.68 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1380  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1311  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.11 
 
 
364 aa  90.9  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.436181  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
120 aa  89.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 
120 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
123 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2244  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
119 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.502053  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3041  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 
125 aa  87  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.605756  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1982  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  47.17 
 
 
344 aa  85.1  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.57 
 
 
350 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.241681  normal  0.456966 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1193  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 
225 aa  84  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3321  chemotaxis protein  37.19 
 
 
125 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.628271  normal  0.0214541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>