More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1289 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  248  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2935  response regulator receiver protein  96 
 
 		 125 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00116443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2886  response regulator receiver protein  63.2 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8267e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  48.31 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  50 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  43.1 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 122 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  43.22 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  40.87 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 120 aa  97.1  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  42.72 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2244  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.502053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.2 
 
 		 218 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  40.34 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 220 aa  93.6  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1982  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 119 aa  93.6  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.65 
 
 		 241 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 227 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 225 aa  90.1  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  38.79 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  38.79 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  38.79 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  38.79 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  38.79 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  38.79 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 1648 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  38.79 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  38.79 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  38.79 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 220 aa  87.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.19 
 
 		 236 aa  87.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2346  histidine kinase  41.38 
 
 		 372 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.2 
 
 		 200 aa  86.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2713  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 208 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 218 aa  85.9  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.66 
 
 		 213 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3028  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.5 
 
 		 225 aa  85.9  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  decreased coverage  0.0000266978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 218 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 213 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.71 
 
 		 231 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.34 
 
 		 230 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 220 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.69 
 
 		 210 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.69 
 
 		 210 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.69 
 
 		 210 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 227 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3195  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.18 
 
 		 226 aa  84.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1193  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  84.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 225 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 226 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  41.53 
 
 		 146 aa  83.6  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 212 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 224 aa  84  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>