More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2346 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2346  histidine kinase  100 
 
 		 372 aa  750    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.7 
 
 		 1187 aa  478  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  39.21 
 
 		 2051 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 865 aa  250  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 935 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 811 aa  239  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  39.73 
 
 		 781 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 939 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 945 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 922 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 750 aa  222  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 937 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  37.33 
 
 		 1257 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 784 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 		 770 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  36.51 
 
 		 1161 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 721 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 929 aa  206  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 		 720 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 		 989 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  37.58 
 
 		 810 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 989 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 1058 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  35 
 
 		 1323 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 		 1127 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  35.01 
 
 		 1124 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 1362 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 		 1099 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  39.83 
 
 		 1153 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 		 1313 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 1127 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  40.21 
 
 		 810 aa  184  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 844 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 844 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 		 645 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 1122 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 1110 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 1068 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  32.98 
 
 		 1125 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  35.19 
 
 		 1140 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  32.96 
 
 		 1132 aa  179  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 		 1285 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 		 1322 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  38.41 
 
 		 800 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 		 1122 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  35.18 
 
 		 853 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 		 846 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 		 807 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 879 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 1068 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 1195 aa  176  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 1611 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 880 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 1070 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 		 1120 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 1578 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  32.08 
 
 		 1121 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  35.81 
 
 		 794 aa  172  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.81 
 
 		 772 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.41 
 
 		 655 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.53 
 
 		 1131 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 1407 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  35.97 
 
 		 678 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 		 1175 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 		 1128 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  38.46 
 
 		 596 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 865 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.35 
 
 		 1173 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  31.55 
 
 		 1122 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  38.03 
 
 		 1023 aa  170  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.81 
 
 		 777 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 1146 aa  169  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 633 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  33.96 
 
 		 1128 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 759 aa  169  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 873 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 1002 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 674 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 		 1363 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 1197 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 631 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 		 1075 aa  166  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 762 aa  166  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  35.14 
 
 		 985 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  38.01 
 
 		 1177 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 803 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  34.46 
 
 		 645 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  33.78 
 
 		 968 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 1064 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.54 
 
 		 1350 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  34.81 
 
 		 1166 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 841 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 944 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 911 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 863 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 1090 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  37.27 
 
 		 779 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 1090 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>