More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0972 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  455  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 253 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  37.26 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  39.63 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 		 236 aa  151  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 		 213 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1736  DNA-binding response regulator NarL  35.68 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  35.68 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2246  DNA-binding response regulator NarL  35.68 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  35.68 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  35.68 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  35.68 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  35.68 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  36.2 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  38.07 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  35.68 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.11 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.61 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  36.92 
 
 		 224 aa  144  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  36.92 
 
 		 224 aa  144  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 1648 aa  144  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  38.61 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.98 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  36.97 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  37.27 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  37.27 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  38.12 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 236 aa  141  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.87 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 244 aa  141  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.74 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  35.21 
 
 		 213 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.88 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  39.15 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  39.15 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1266  two-component response regulator  38.39 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.847879  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  39.15 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  39.15 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.44 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  39.15 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  39.53 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  39.53 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  39.53 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.87 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  39.53 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  39.53 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  39.53 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  39.53 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.79 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  37.96 
 
 		 217 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>