More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2589 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  99.07 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  99.07 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  99.53 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  88.84 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  88.84 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  88.84 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  88.84 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  88.84 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  88.84 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  88.84 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  88.37 
 
 		 215 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  88.37 
 
 		 215 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  68.54 
 
 		 210 aa  285  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  68.54 
 
 		 210 aa  285  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  68.6 
 
 		 210 aa  278  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  68.63 
 
 		 209 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  68.63 
 
 		 209 aa  275  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 209 aa  275  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  59.9 
 
 		 209 aa  251  5.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0613  nitrate/nitrite response regulator NarP  59.61 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  55.67 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.43 
 
 		 209 aa  221  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  53.43 
 
 		 209 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  53.43 
 
 		 209 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  53.43 
 
 		 209 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161759  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000509  nitrate/nitrite response regulator protein  57.14 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0656  two component LuxR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  0.140804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  51.47 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05381  transcriptional dual regulator NarL  57.84 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 209 aa  215  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  53.66 
 
 		 209 aa  214  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0646  response regulator receiver protein  52.2 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0492071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0683  two component LuxR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 209 aa  208  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000388278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  50.24 
 
 		 219 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  50.24 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  47.42 
 
 		 217 aa  194  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  45.37 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  47.57 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1951  putative nitrate/nitrite response regulator; NarL  49.05 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120802  normal  0.965323 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  44.13 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2900  transcriptional regulator NarL  43.93 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2637  two component LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 213 aa  168  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0573022  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  46.12 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  43.15 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  46.57 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  41.98 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  43.5 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  40.1 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2568  transcriptional regulator NarL  45.15 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  46.08 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  39.71 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  41.12 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2262  transcriptional regulator NarL  45.19 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1736  DNA-binding response regulator NarL  39.56 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  39.56 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2246  DNA-binding response regulator NarL  39.56 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  39.56 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  39.56 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  39.56 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  39.56 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  39.11 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.18 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 234 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.07 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1904  transcriptional regulator NarL  43.54 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1962  transcriptional regulator NarL  43.54 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.356331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1556  transcriptional regulator NarL  43.54 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1898  transcriptional regulator NarL  43.54 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.335981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1373  transcriptional regulator NarL  43.54 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.276843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 234 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  40.38 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>