More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3502 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 227 aa  224  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.26 
 
 		 216 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 235 aa  141  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 218 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 213 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.74 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  35.68 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.27 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  37.44 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.62 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.7 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  41.29 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 206 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  37.16 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  38.43 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  37.86 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  38.25 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0080  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0642  putative response regulator  38.14 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.95 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1059  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  40.47 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.32 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  36.02 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  36.02 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  36.02 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  36.02 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.02 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  35.85 
 
 		 219 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 237 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.74 
 
 		 227 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  35.22 
 
 		 242 aa  124  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  36.71 
 
 		 218 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  31.73 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  37.67 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.73 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.17 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.21 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4059  two component LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  36.11 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.27 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.82 
 
 		 1648 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>