More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2935 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2935  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00116443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  96 
 
 		 125 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2886  response regulator receiver protein  63.2 
 
 		 125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8267e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  48.31 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  43.97 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 122 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  43.22 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  41.74 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 120 aa  95.9  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 119 aa  95.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 120 aa  94.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  43.69 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2244  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 119 aa  93.6  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.502053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 118 aa  93.2  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.65 
 
 		 241 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1982  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 227 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 220 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  37.82 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  39.66 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  39.66 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  39.66 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  39.66 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  39.66 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  39.66 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.6 
 
 		 218 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  39.66 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  39.66 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  39.66 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.32 
 
 		 225 aa  87  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 1648 aa  87  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 119 aa  86.7  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 218 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.54 
 
 		 231 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 125 aa  84.7  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 220 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 236 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3195  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 213 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.69 
 
 		 213 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 230 aa  83.6  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  43.22 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.35 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.16 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.98 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.28 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 1066 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1380  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2346  histidine kinase  39.66 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2188  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.546074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1193  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>