More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0863 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  78.15 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  78.15 
 
 		 120 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  78.99 
 
 		 120 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  77.31 
 
 		 120 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  78.99 
 
 		 120 aa  193  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  78.15 
 
 		 120 aa  193  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  77.78 
 
 		 120 aa  190  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  77.78 
 
 		 120 aa  190  7e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  75.63 
 
 		 120 aa  189  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  77.59 
 
 		 119 aa  188  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  76.92 
 
 		 120 aa  188  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  75.63 
 
 		 120 aa  188  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  76.47 
 
 		 123 aa  187  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  76.72 
 
 		 119 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  76.52 
 
 		 119 aa  186  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  75.63 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  73.95 
 
 		 120 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  76.72 
 
 		 119 aa  181  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  72.27 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  75.21 
 
 		 119 aa  180  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  75.86 
 
 		 119 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  69.23 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  69.17 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  64.41 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  64.41 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  64.41 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  64.41 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  64.41 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  64.41 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  64.41 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  64.41 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  64.41 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  64.41 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  64.41 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  61.21 
 
 		 119 aa  160  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  68.7 
 
 		 117 aa  159  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  63.03 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  63.03 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  63.03 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  63.03 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  62.07 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  63.48 
 
 		 117 aa  147  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 117 aa  147  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  59.13 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  56.03 
 
 		 120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  57.76 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  59.5 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  56.03 
 
 		 120 aa  140  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  53.51 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  54.7 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  52.17 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  54.95 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  51.75 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  55.86 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  50 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  55.86 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  50 
 
 		 234 aa  124  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 123 aa  124  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  45.69 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  52.59 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 123 aa  120  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  46.55 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  50 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 118 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  47.46 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  46.09 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2935  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00116443  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 1066 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.35 
 
 		 227 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.23 
 
 		 205 aa  99  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  42.24 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  44.25 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 119 aa  97.8  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0692  CheY  42.02 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0775756  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 214 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0170  response regulator receiver protein  44.66 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000628912  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  46.15 
 
 		 206 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  48.11 
 
 		 390 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.34 
 
 		 368 aa  94.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3041  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.605756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3321  chemotaxis protein  41.44 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.628271  normal  0.0214541 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  51.43 
 
 		 344 aa  94.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  51.43 
 
 		 344 aa  94.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.76 
 
 		 350 aa  94  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.241681  normal  0.456966 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 218 aa  94  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>