More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2129 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  100 
 
 		 118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  77.97 
 
 		 118 aa  190  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  64.96 
 
 		 117 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  65.22 
 
 		 120 aa  157  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  64.91 
 
 		 120 aa  157  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  61.86 
 
 		 119 aa  156  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  64.35 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  64.35 
 
 		 123 aa  154  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  60.53 
 
 		 119 aa  154  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  62.28 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  62.28 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  62.61 
 
 		 120 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  61.02 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  59.65 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  57.39 
 
 		 121 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  59.13 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  61.02 
 
 		 119 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  59.83 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  59.13 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  56.78 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  55.08 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  56.9 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  53.39 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  53.91 
 
 		 122 aa  133  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  53.04 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  53.04 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  57.89 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  56.41 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  53.04 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  53.04 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  53.04 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  53.04 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  53.04 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  53.04 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  53.39 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  51.69 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 120 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  47.86 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  54.78 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  50 
 
 		 119 aa  124  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 123 aa  123  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  52.54 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 122 aa  120  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  53.04 
 
 		 122 aa  120  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 122 aa  120  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 118 aa  120  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  50 
 
 		 119 aa  120  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  50 
 
 		 120 aa  117  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  51.75 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  47.37 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  50 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  44.44 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  50 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 123 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 234 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 129 aa  97.1  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0161  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 232 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 1066 aa  93.6  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  40.87 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  41.88 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 1648 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  44.66 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 564 aa  90.1  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2935  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00116443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  41.23 
 
 		 151 aa  90.1  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 231 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 391 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.64 
 
 		 224 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 224 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 224 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  88.6  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 228 aa  88.2  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  40 
 
 		 224 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1693  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>