More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3461 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  100 
 
 
122 aa  248  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  54.7 
 
 
121 aa  120  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  48.33 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  46.67 
 
 
122 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  46.67 
 
 
122 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  46.67 
 
 
122 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  48.72 
 
 
122 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  45 
 
 
120 aa  106  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  47.06 
 
 
121 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  44.17 
 
 
120 aa  104  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  44.92 
 
 
119 aa  104  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  45.38 
 
 
120 aa  103  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  45.38 
 
 
120 aa  103  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2935  response regulator receiver protein  45.61 
 
 
125 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00116443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  43.1 
 
 
119 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  43.1 
 
 
119 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  40.68 
 
 
122 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  45.61 
 
 
125 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  43.1 
 
 
120 aa  100  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  42.61 
 
 
120 aa  100  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  47.86 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2886  response regulator receiver protein  45.95 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8267e-27 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  40 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  43.59 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  40 
 
 
120 aa  99  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  44.74 
 
 
119 aa  98.6  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
120 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  43.22 
 
 
122 aa  98.6  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  45.61 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  43.22 
 
 
123 aa  97.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  42.48 
 
 
119 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  38.79 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  47.66 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
120 aa  94.7  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  45 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  42.74 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  44.34 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  42.24 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2244  response regulator receiver protein  42.61 
 
 
119 aa  90.9  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.502053  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  34.71 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  34.71 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  34.71 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  34.71 
 
 
122 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  34.71 
 
 
122 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  34.71 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  34.71 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  34.71 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  34.71 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  34.71 
 
 
122 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  43.4 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1982  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
119 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  34.71 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  41.44 
 
 
119 aa  88.2  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
119 aa  87  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
122 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  37.39 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  34.17 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  41.44 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1380  response regulator receiver protein  40.19 
 
 
124 aa  84.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  41.44 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  39.83 
 
 
216 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  38.46 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  32.46 
 
 
1066 aa  80.1  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.17 
 
 
461 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  34.23 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0827  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  39.66 
 
 
460 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  36.67 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  33.91 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  38.26 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
1322 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.94 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  37.07 
 
 
460 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0386  response regulator receiver domain-containing protein  35.78 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.94 
 
 
456 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3195  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  43.14 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7263  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
219 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>