More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2016 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  100 
 
 
119 aa  236  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  95.8 
 
 
119 aa  230  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  77.12 
 
 
119 aa  194  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  80.51 
 
 
119 aa  193  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  77.78 
 
 
120 aa  192  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  77.78 
 
 
120 aa  192  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  77.59 
 
 
120 aa  188  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  75.44 
 
 
120 aa  185  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  75.44 
 
 
120 aa  185  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  72.65 
 
 
120 aa  185  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  71.79 
 
 
120 aa  184  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  73.28 
 
 
120 aa  184  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  72.41 
 
 
120 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  73.28 
 
 
120 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  70.94 
 
 
121 aa  180  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  74.34 
 
 
119 aa  178  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  70.69 
 
 
120 aa  178  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  70.69 
 
 
123 aa  176  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  70.94 
 
 
120 aa  174  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  67.24 
 
 
122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  68.97 
 
 
122 aa  169  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  69.57 
 
 
122 aa  168  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  69.57 
 
 
122 aa  168  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  69.57 
 
 
122 aa  168  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  69.57 
 
 
122 aa  167  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  69.57 
 
 
122 aa  168  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  69.57 
 
 
122 aa  167  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  68.7 
 
 
122 aa  166  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  68.7 
 
 
122 aa  166  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  68.7 
 
 
122 aa  166  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  68.7 
 
 
122 aa  166  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  68.7 
 
 
144 aa  166  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  67.8 
 
 
119 aa  166  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  64.04 
 
 
122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  62.71 
 
 
119 aa  164  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  63.79 
 
 
122 aa  158  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  56.78 
 
 
118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  55.46 
 
 
120 aa  150  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  61.21 
 
 
117 aa  150  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  62.93 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  57.26 
 
 
122 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  57.26 
 
 
122 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  57.26 
 
 
122 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  54.62 
 
 
120 aa  144  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  55.56 
 
 
122 aa  143  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  52.54 
 
 
120 aa  142  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  55.08 
 
 
118 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  51.69 
 
 
120 aa  140  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  52.54 
 
 
120 aa  140  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  56.9 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  52.59 
 
 
121 aa  136  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  56.78 
 
 
123 aa  135  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  56.52 
 
 
122 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  52.99 
 
 
121 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  56.14 
 
 
121 aa  131  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  56.76 
 
 
123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  49.57 
 
 
117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
234 aa  127  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  52.14 
 
 
123 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  54.63 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  55.14 
 
 
121 aa  120  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  45.69 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  48.74 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  46.61 
 
 
120 aa  116  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  52.34 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  47.46 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  45.3 
 
 
123 aa  114  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  49.14 
 
 
125 aa  114  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
123 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  46.02 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  45.3 
 
 
123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  44.92 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  44.07 
 
 
119 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  43.86 
 
 
1066 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0692  CheY  44.74 
 
 
146 aa  104  4e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0775756  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  44.64 
 
 
120 aa  104  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3321  chemotaxis protein  45.13 
 
 
125 aa  103  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.628271  normal  0.0214541 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
118 aa  103  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  43.1 
 
 
122 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0161  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 
169 aa  100  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
214 aa  100  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  43.22 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  42.24 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  44.35 
 
 
120 aa  98.2  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  41.03 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  50 
 
 
390 aa  97.1  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  43.12 
 
 
119 aa  97.1  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.99 
 
 
350 aa  96.7  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.241681  normal  0.456966 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0170  response regulator receiver protein  43.69 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000628912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2935  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00116443  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  42.61 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3041  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.605756  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
119 aa  95.5  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  50.94 
 
 
344 aa  94.7  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  47.62 
 
 
344 aa  94.4  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  50.94 
 
 
344 aa  94.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0246  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 
225 aa  94  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0272164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.88 
 
 
419 aa  94  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>