More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1448 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  257  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 119 aa  107  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  45.87 
 
 		 117 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  45.69 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  45.22 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 119 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 118 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 120 aa  96.7  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  42.24 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  42.24 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  42.24 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0386  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  38.28 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 548 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  35.04 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 117 aa  90.9  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.43 
 
 		 231 aa  90.9  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 120 aa  90.1  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 391 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 1648 aa  88.6  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  38.84 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 206 aa  87.4  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2234  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 1066 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 121 aa  84.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.03 
 
 		 210 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0692  CheY  34.11 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0775756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.03 
 
 		 210 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.03 
 
 		 210 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 214 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.02 
 
 		 346 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.5 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.34 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  32.31 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3740  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 234 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3166  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.32 
 
 		 213 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>