More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1794 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  100 
 
 
123 aa  248  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  72.5 
 
 
123 aa  180  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  58.47 
 
 
122 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  58.47 
 
 
122 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  58.47 
 
 
122 aa  148  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  58.47 
 
 
122 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  58.47 
 
 
122 aa  148  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  58.47 
 
 
122 aa  148  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  58.47 
 
 
122 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  58.47 
 
 
122 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  58.47 
 
 
122 aa  148  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  58.47 
 
 
122 aa  148  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  58.47 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  58.62 
 
 
144 aa  142  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  59.5 
 
 
120 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  58.33 
 
 
120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  57.26 
 
 
123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  58.33 
 
 
120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  56.78 
 
 
119 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  59.48 
 
 
120 aa  135  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  55.93 
 
 
122 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  56.78 
 
 
119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  53.39 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  54.24 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  55.93 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  51.28 
 
 
120 aa  130  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  55.26 
 
 
119 aa  129  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  50.85 
 
 
120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  53.45 
 
 
120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  54.7 
 
 
120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  52.54 
 
 
122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  51.69 
 
 
120 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  52.99 
 
 
119 aa  127  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  52.99 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  52.59 
 
 
120 aa  124  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  50.43 
 
 
118 aa  123  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  51.72 
 
 
120 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  55.56 
 
 
119 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  48.67 
 
 
119 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  50.88 
 
 
117 aa  120  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  47.86 
 
 
118 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  53.45 
 
 
117 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
123 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  46.36 
 
 
123 aa  110  9e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
120 aa  110  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  44.55 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  48.18 
 
 
121 aa  107  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  43.86 
 
 
117 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 
122 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  43.1 
 
 
121 aa  105  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
120 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  44.55 
 
 
123 aa  106  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  40.68 
 
 
121 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
1066 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  40.68 
 
 
120 aa  105  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  43.22 
 
 
122 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  43.22 
 
 
122 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 
122 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  42.37 
 
 
122 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  41.38 
 
 
120 aa  102  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  42.02 
 
 
120 aa  101  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
117 aa  98.6  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 
120 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  38.84 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  45.37 
 
 
390 aa  98.2  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1380  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  41.88 
 
 
119 aa  97.1  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  42.61 
 
 
119 aa  95.9  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 
344 aa  95.9  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  40.37 
 
 
234 aa  95.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.77 
 
 
346 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.81 
 
 
350 aa  95.9  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.241681  normal  0.456966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3271  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  37.72 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
655 aa  94.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.748554  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
120 aa  94.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1693  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
123 aa  94.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  41.88 
 
 
120 aa  94.4  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 
223 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
118 aa  92  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  36.84 
 
 
229 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  36.36 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
118 aa  92  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
214 aa  90.5  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0473  chemotaxis-specific methylesterase  40.19 
 
 
395 aa  90.1  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  40.17 
 
 
130 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  41.9 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  37.82 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 
217 aa  89.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
412 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3026  chemotaxis-specific methylesterase  42.06 
 
 
379 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0692  CheY  38.98 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0775756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
216 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  39.25 
 
 
345 aa  87.8  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  42.45 
 
 
344 aa  87.4  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  35 
 
 
391 aa  87.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  42.45 
 
 
344 aa  87.4  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
129 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>