More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3271 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3271  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 123 aa  245  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1693  response regulator receiver protein  89.43 
 
 		 123 aa  223  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0386  response regulator receiver domain-containing protein  53.39 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 119 aa  93.6  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  36.36 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  36.36 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  36.36 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  36.36 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  36.36 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  36.36 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  36.36 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  36.36 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  36.36 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 214 aa  87  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1372  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000494587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0776  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 454 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 543 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  35 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1619  chemotaxis protein CheY  38.53 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.71 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  36.79 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1607  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 245 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 1066 aa  80.1  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2117  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.66 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1380  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1886  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.71 
 
 		 461 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  36.61 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2741  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000066775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.67 
 
 		 346 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  36.94 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  32 
 
 		 457 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 460 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 214 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.61 
 
 		 213 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  32.76 
 
 		 597 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  35.71 
 
 		 460 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.4 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02147  fused response regulator of ato operon, in two-component system with AtoS: response regulator/sigma54 interaction protein  34.51 
 
 		 461 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.51 
 
 		 461 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  33.96 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  34.51 
 
 		 461 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  34.51 
 
 		 461 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  33.03 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  34.51 
 
 		 461 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  34.51 
 
 		 461 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.77 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>