More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1693 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1693  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  244  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3271  response regulator receiver domain-containing protein  89.43 
 
 		 123 aa  223  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0386  response regulator receiver domain-containing protein  54.17 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 		 120 aa  93.6  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 117 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 209 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  33.06 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  33.06 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  33.06 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  33.06 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  33.06 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  33.06 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  33.06 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  33.06 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 1066 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  33.06 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2117  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.82 
 
 		 352 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 209 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 211 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  80.5  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 213 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0776  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 454 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.71 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  32.23 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  32.23 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  32.23 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  32.23 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  33.64 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 543 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1380  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  32.71 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.84 
 
 		 346 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1619  chemotaxis protein CheY  37.61 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1607  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2304  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.61 
 
 		 360 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1372  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000494587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2741  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000066775  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1886  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.43 
 
 		 461 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0248  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.44 
 
 		 358 aa  77  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.185703  normal  0.030578 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 225 aa  77  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0748  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.32 
 
 		 355 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0763  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.32 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.67842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 460 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  32.11 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  38.46 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.3 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  30.28 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.55 
 
 		 470 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>