More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1372 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1372  response regulator receiver protein  100 
 
 		 119 aa  241  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000494587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1619  chemotaxis protein CheY  79.49 
 
 		 119 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1607  response regulator receiver domain-containing protein  77.78 
 
 		 119 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2741  response regulator receiver protein  75.21 
 
 		 119 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000066775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  39.47 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  39.47 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  38.6 
 
 		 122 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  38.6 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  38.6 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  38.6 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  38.6 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  38.6 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  37.72 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 117 aa  87  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  40 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 123 aa  84.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3271  response regulator receiver domain-containing protein  38.39 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  40.35 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1387  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.925745  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 1066 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  40 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2323  two component CheB methylesterase  45 
 
 		 370 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3026  chemotaxis-specific methylesterase  42.06 
 
 		 379 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2235  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.86 
 
 		 355 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2276  chemotaxis-specific methylesterase  45.79 
 
 		 371 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.574924  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.81 
 
 		 346 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3867  chemotaxis-specific methylesterase  44.86 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3045  chemotaxis-specific methylesterase  42.99 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45580  chemotaxis-specific methylesterase  44.86 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  0.505657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4059  two component LuxR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2915  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 		 375 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1382  chemotaxis-specific methylesterase  44.86 
 
 		 393 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1458  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 		 375 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1303  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1370  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 		 374 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2555  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.766083  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1363  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 		 374 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3047  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 		 375 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2905  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  44.86 
 
 		 345 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0386  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 416 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  39.47 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03140  chemotaxis-specific methylesterase  42.06 
 
 		 371 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  42.48 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.28 
 
 		 353 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1639  chemotaxis-specific methylesterase  42.99 
 
 		 372 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  41.35 
 
 		 417 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1693  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1203  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 		 398 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1347  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 		 388 aa  77  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1971  chemotaxis-specific methylesterase  40.57 
 
 		 381 aa  77  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.39 
 
 		 1648 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  38.46 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  33.91 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002836  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase CheB  41.12 
 
 		 370 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.07 
 
 		 486 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>