More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3209 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  100 
 
 		 416 aa  837    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  63.79 
 
 		 430 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  63.55 
 
 		 430 aa  520  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  59.28 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  38.88 
 
 		 412 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  35.57 
 
 		 392 aa  270  5e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  31 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  33.68 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  32.63 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  32.89 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  27.16 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  31.31 
 
 		 397 aa  155  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  29.02 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  32.59 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.75 
 
 		 377 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  29.11 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  29.41 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  29.34 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  26.96 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.36 
 
 		 423 aa  133  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  31.38 
 
 		 377 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 389 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  29.19 
 
 		 401 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  24.18 
 
 		 412 aa  127  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  24.93 
 
 		 392 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  27.52 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.06 
 
 		 398 aa  124  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.78 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  27.65 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.21 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  26.77 
 
 		 423 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  27.54 
 
 		 400 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  26.95 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.78 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  26.89 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.22 
 
 		 205 aa  107  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.91 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  25.74 
 
 		 402 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  25.23 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  25.77 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  25.48 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  24.45 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  24.38 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.34 
 
 		 224 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.49 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  24.38 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 222 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.84 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  24.93 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  25.57 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  24.93 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  24.93 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  24.93 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.29 
 
 		 209 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 216 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  24.17 
 
 		 414 aa  100  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  27.99 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 225 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  40.69 
 
 		 207 aa  96.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.46 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 225 aa  94.7  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  25.55 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.54 
 
 		 216 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 217 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 212 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 212 aa  93.6  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  41.88 
 
 		 216 aa  93.2  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  93.2  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  37.82 
 
 		 215 aa  92.8  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  25.97 
 
 		 402 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.59 
 
 		 201 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 201 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3287  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 233 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0842926  normal  0.330639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  25.97 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  40.68 
 
 		 215 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 216 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 211 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 214 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 222 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  23.85 
 
 		 422 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 232 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.13 
 
 		 224 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 219 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 226 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 216 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.34 
 
 		 214 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  42.74 
 
 		 212 aa  90.1  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 219 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 228 aa  90.1  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 201 aa  89.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 218 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  42.37 
 
 		 218 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>