More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1187 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  91 
 
 		 400 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  100 
 
 		 400 aa  800    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  71.5 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  56.5 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  43.67 
 
 		 397 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  44.22 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  36.32 
 
 		 402 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  38.32 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  37.47 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  37.22 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  37.22 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 402 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  36.32 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  36.23 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  36.23 
 
 		 402 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  35.98 
 
 		 402 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  35.98 
 
 		 402 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  34.12 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  33.51 
 
 		 412 aa  205  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  35.91 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  35.1 
 
 		 383 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.39 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  31.31 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.37 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.6 
 
 		 381 aa  133  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  27.49 
 
 		 392 aa  123  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  28.34 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  30.12 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.54 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  29.18 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  28.88 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  25.91 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  27.6 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  31.92 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  29.21 
 
 		 413 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.11 
 
 		 398 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.95 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  25.33 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  26.82 
 
 		 416 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  26.46 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.42 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.17 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.94 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  27.51 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.42 
 
 		 389 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.67 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  27.36 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  26.06 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  25.89 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.77 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  29.94 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  26.36 
 
 		 528 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.28 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  27.49 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  23.05 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  23.49 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  25.44 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.49 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  26.3 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  25.15 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.41 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  23.29 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  26 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  27.78 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.2 
 
 		 262 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.86 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.6 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1206  type II secretion system protein E  23.89 
 
 		 742 aa  73.9  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00140506  hitchhiker  0.00000000000153533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  22.99 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.08 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.53 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  25.68 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  22.22 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  25.68 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.05 
 
 		 265 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  25.3 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  22.29 
 
 		 580 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  29.17 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  26.44 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  29.48 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  29.64 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.5 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.46 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>