More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1110 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  100 
 
 		 404 aa  808    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  51.91 
 
 		 481 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  50.13 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  33.52 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  30.06 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  31.56 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  30.34 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  33.99 
 
 		 373 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  26.81 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  33.23 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.52 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  28.61 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  30.5 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.48 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  30.57 
 
 		 416 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.86 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  26.46 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  25.8 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 412 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  29.29 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  30.39 
 
 		 413 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  25.63 
 
 		 412 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  26.79 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  27.73 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.48 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.77 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  30.82 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  27.37 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.62 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  27.99 
 
 		 416 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  29.45 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  29.45 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  29.45 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  29.45 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  29.45 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  29.45 
 
 		 405 aa  106  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  29.45 
 
 		 405 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  27.51 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.88 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  26.69 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  29.39 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  26.97 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  25.22 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  25.79 
 
 		 390 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  29.45 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  29.45 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  29.45 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  28.86 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.11 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  27.54 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.52 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  27.54 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  24.56 
 
 		 417 aa  99.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  28.77 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  27.81 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  27.16 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  27.32 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  26.71 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  29.87 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.99 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  28.29 
 
 		 424 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  25.21 
 
 		 537 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  29.94 
 
 		 400 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  29.65 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  27.16 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  28.93 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  27.3 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  27.7 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  27.96 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 587 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  25.82 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  29.25 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  26.51 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  26.59 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  27.36 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  27.14 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  26.73 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.16 
 
 		 381 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  25.52 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  27.48 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  23.73 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.71 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2703  pilus assembly protein CpaE, putative  27.64 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711069  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2325  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  27.64 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.571647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  25.98 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.6 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  27.83 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  26.38 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.99 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>