145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2797 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  90.8 
 
 
413 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  100 
 
 
413 aa  816    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  68.04 
 
 
412 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  68.04 
 
 
412 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  68.28 
 
 
412 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  68.04 
 
 
412 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  68.04 
 
 
412 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  68.04 
 
 
412 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  63.53 
 
 
424 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  66.59 
 
 
412 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  66.59 
 
 
412 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  67.49 
 
 
405 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  67.49 
 
 
405 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  66.59 
 
 
412 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  65.62 
 
 
412 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  62.82 
 
 
424 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  63.26 
 
 
426 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  45.77 
 
 
412 aa  312  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  44.82 
 
 
427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  43.73 
 
 
423 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  43.86 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  43.86 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  42.36 
 
 
439 aa  280  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  38.92 
 
 
508 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  38.46 
 
 
403 aa  190  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  28.25 
 
 
396 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  29.35 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2703  pilus assembly protein CpaE, putative  27.8 
 
 
409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711069  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2325  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  27.8 
 
 
409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.571647  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  28.72 
 
 
396 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  28.27 
 
 
418 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  27.68 
 
 
396 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  28.35 
 
 
394 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  28.97 
 
 
394 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  27.18 
 
 
396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  29.49 
 
 
389 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  22.82 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.65 
 
 
377 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  28.33 
 
 
404 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  26.48 
 
 
413 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  23.51 
 
 
373 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  24.52 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.81 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.51 
 
 
414 aa  84  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  25.48 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  24.84 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.25 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  26.39 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  22.67 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0071  response regulator receiver protein  27.55 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.623542 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.04 
 
 
391 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  28.01 
 
 
397 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  22.69 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.26 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.77 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  26.45 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  23.4 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  24.2 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  29.32 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.35 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  25.76 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  24.78 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3513  response regulator receiver protein  26.27 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  25.09 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  22.73 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  24.41 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  25.56 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  23.12 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.23 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  27.17 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.19 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  24.63 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  26.2 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  21.61 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  21.78 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  24.73 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  26.64 
 
 
414 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  23.73 
 
 
428 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  21.73 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  21.85 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  23.69 
 
 
428 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  22.73 
 
 
430 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.95 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  26.82 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  20.67 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  24.78 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  24.36 
 
 
391 aa  60.1  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  19.57 
 
 
397 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  21.08 
 
 
381 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.71 
 
 
423 aa  59.7  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  21.48 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.26 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  21.52 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  24.64 
 
 
400 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  24.4 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  23.1 
 
 
425 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  22.77 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  23.29 
 
 
417 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  24 
 
 
528 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  23.66 
 
 
580 aa  56.2  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>