228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3522 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  82.35 
 
 		 421 aa  726    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  90.12 
 
 		 423 aa  788    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  92.71 
 
 		 425 aa  815    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  85.88 
 
 		 423 aa  758    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  100 
 
 		 425 aa  864    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  84.94 
 
 		 422 aa  741    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  84.94 
 
 		 422 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  68.47 
 
 		 422 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  61.5 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  62.2 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  58.52 
 
 		 414 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  58.75 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  58.25 
 
 		 414 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  58 
 
 		 414 aa  488  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  54.36 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  51.36 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  49.65 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  48.93 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  51.04 
 
 		 437 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  50.24 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  48.51 
 
 		 528 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  49.49 
 
 		 493 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  46.97 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  40.61 
 
 		 580 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  39.95 
 
 		 587 aa  309  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  30.66 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  29.54 
 
 		 422 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  30.55 
 
 		 422 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  31.12 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  31.13 
 
 		 413 aa  126  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  28.9 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.91 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  28.49 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 401 aa  120  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  28.53 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  28.53 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  28.53 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  28.53 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  28.53 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  28.53 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  28.25 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  27.46 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.03 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  28.07 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  29.35 
 
 		 399 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  25.3 
 
 		 444 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.62 
 
 		 397 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  27.9 
 
 		 403 aa  93.2  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  26.61 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  26.61 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.98 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  24.28 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  25 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  23.95 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  23.64 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  26.07 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  24.24 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.76 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  28.14 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  23.59 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  23.32 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  21.28 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  24.13 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  24.19 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  23.48 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.71 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.65 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  24.35 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0897  response regulator receiver protein  27.41 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.97 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  25.32 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  22.78 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  22.78 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  21.69 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  26.59 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  22.76 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  25.87 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.48 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  23.47 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  21.79 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  23.47 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  23.15 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  27.1 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  24.26 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  24.32 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  20.8 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  23.84 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  23.81 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  23.81 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  23.81 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  23.81 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  23.81 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  23.81 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  23.81 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>