More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5685 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  100 
 
 		 422 aa  858    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  68.47 
 
 		 425 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  68 
 
 		 425 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  67.69 
 
 		 423 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  66.59 
 
 		 422 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  66.9 
 
 		 423 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  66.35 
 
 		 422 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  65.4 
 
 		 421 aa  568  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  53.69 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  54.2 
 
 		 414 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  53.12 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  52.35 
 
 		 414 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  52.59 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  52.59 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 422 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  47.44 
 
 		 528 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  48.61 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  48.45 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  45.27 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 493 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  47.91 
 
 		 425 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  46.4 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  44.09 
 
 		 423 aa  316  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  37.93 
 
 		 580 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 587 aa  274  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  29.94 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  28.38 
 
 		 422 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  26.77 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.05 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  29.15 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  25.57 
 
 		 389 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  26.16 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  27.98 
 
 		 391 aa  99  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  26.07 
 
 		 405 aa  97.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  25.67 
 
 		 407 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  25.87 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  25.93 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  25.93 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  25.93 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  25.93 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  25.93 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  25.93 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  30.26 
 
 		 444 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  28.08 
 
 		 403 aa  89.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  28.62 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  24.81 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  27.93 
 
 		 416 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  27.3 
 
 		 447 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  27.3 
 
 		 447 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.69 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  25.71 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  25.59 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  23.14 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  24.73 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.16 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  22.09 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  26.04 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  23.08 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  23.82 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  28.35 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  24.34 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  25.18 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  24.39 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  25.18 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  24.34 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  25.18 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.2 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.65 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  25.76 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.62 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3409  septum site-determining protein MinD  26.85 
 
 		 270 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  24.81 
 
 		 400 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  22.03 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.07 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  26.85 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  21.74 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  23.16 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  25.48 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  24.45 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.81 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  26.24 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  27.33 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  27.33 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  25.38 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  26.71 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  25.88 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  21.68 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  26.71 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  22.12 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0897  response regulator receiver protein  28.62 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  22.33 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.54 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>