More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0422 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  100 
 
 		 444 aa  895    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  80.63 
 
 		 416 aa  686    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  55.71 
 
 		 419 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  55.21 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 430 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  32.36 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  30.66 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  30.96 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  25.96 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 373 aa  152  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  33.24 
 
 		 373 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  33.44 
 
 		 373 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  33.09 
 
 		 399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 376 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  31.04 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.47 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  31.12 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  32.78 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  26.13 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  28.17 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  31.97 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.02 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  28.74 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  24.26 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  31.43 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  26.78 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  27.35 
 
 		 422 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.33 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.43 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  31.02 
 
 		 389 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  24.78 
 
 		 587 aa  106  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  27.3 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  27.17 
 
 		 425 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  27.09 
 
 		 428 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.37 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  27.15 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  25.81 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  24.85 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.14 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  28.36 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  27.51 
 
 		 400 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  35.53 
 
 		 407 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  24.32 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  26.48 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 414 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  27.13 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  25.3 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  28.17 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  26.87 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  26.5 
 
 		 537 aa  93.6  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  23.39 
 
 		 580 aa  94  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.16 
 
 		 377 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  26.19 
 
 		 414 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  24.71 
 
 		 528 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  24.1 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  24.1 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.28 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  24.93 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  26.35 
 
 		 481 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  27.08 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  26.19 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  25.81 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  23.18 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  25.58 
 
 		 439 aa  90.5  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.56 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  30.26 
 
 		 422 aa  89.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  22.82 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  25.16 
 
 		 425 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  24.55 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  25.26 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  23.68 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  22.04 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  25.17 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  26.18 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  22.08 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  23.25 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  25.89 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  24.33 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  24.1 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  27.18 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  23.7 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0896  septum site-determining protein MinD  28.24 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.015324  hitchhiker  0.00397046 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  24.47 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  28.31 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  24.32 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  24.32 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  23.55 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  23.55 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  23.55 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  26.49 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  29.71 
 
 		 265 aa  76.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  26.54 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3478  septum site-determining protein MinD  26.27 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144531  normal  0.63228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>