More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3115 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  100 
 
 		 395 aa  767    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.7 
 
 		 423 aa  236  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  39.21 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  33.33 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  38.23 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  36.26 
 
 		 401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  35.26 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  36.53 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  34.5 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.74 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 416 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  32.78 
 
 		 419 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  32.87 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  34.25 
 
 		 416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  33.44 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  35.1 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  28.88 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  36.25 
 
 		 407 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  33.11 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 389 aa  122  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  34.26 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  33.13 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  30.12 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  29.65 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  29.74 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  28.19 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  26.69 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 420 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  28.97 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.74 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  30.24 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  29.15 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.47 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  30.54 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  28.19 
 
 		 376 aa  96.3  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.08 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  31.28 
 
 		 537 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.86 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  31.49 
 
 		 404 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  26.53 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  25.37 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  25.53 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.2 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  29.49 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  27.57 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  27.57 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  27.57 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  27.39 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  27.19 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  27.19 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  26.57 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  28.4 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  26.14 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  26.89 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  28.34 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  27.53 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  28.52 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  35.26 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  31.84 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  32.72 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  28.25 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  27.97 
 
 		 528 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0721  chromosome partitioning ATPase  30.54 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  29.75 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  26.97 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  31.11 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  28.08 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  26.38 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  27.92 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  27.83 
 
 		 587 aa  76.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  25.91 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  26.06 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  26.06 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  26.06 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  26.06 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  26.06 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  26.06 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5651  septum site-determining protein MinD  28.11 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  26.06 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.37 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  30.97 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  30.86 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3478  septum site-determining protein MinD  26.34 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144531  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  28.73 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  25.33 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  25.33 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3507  cell division inhibitor  29.07 
 
 		 271 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00615597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>