More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2647 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  100 
 
 
398 aa  799    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  74.12 
 
 
398 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  57.61 
 
 
401 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  59.3 
 
 
399 aa  475  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.79 
 
 
391 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  49.13 
 
 
407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  37.46 
 
 
395 aa  192  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.04 
 
 
423 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  33.15 
 
 
397 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  28.45 
 
 
430 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  29.19 
 
 
430 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  27.59 
 
 
392 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  29.78 
 
 
417 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  31.04 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  30.95 
 
 
416 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  28.22 
 
 
419 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  29.17 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  26.3 
 
 
387 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  29.84 
 
 
373 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  25.6 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  29.3 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  29.43 
 
 
390 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  26.97 
 
 
416 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  27.64 
 
 
419 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  26.5 
 
 
402 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  28.49 
 
 
406 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  27.54 
 
 
391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  25.96 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  24.94 
 
 
383 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.93 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  27.74 
 
 
392 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  25.94 
 
 
376 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  26.38 
 
 
412 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  27.67 
 
 
420 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  27.36 
 
 
400 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  28.62 
 
 
404 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  26.42 
 
 
400 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.52 
 
 
381 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25 
 
 
389 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.98 
 
 
381 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.6 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.94 
 
 
381 aa  97.4  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.66 
 
 
377 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  25.88 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  25.74 
 
 
397 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.56 
 
 
391 aa  90.9  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  27.24 
 
 
402 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  24.36 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  27.24 
 
 
402 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  25.39 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  23.6 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  27.24 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  26.54 
 
 
402 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  27.6 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  26.21 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  26.21 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  24.44 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  25.89 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.92 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  28.15 
 
 
537 aa  84  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  27 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  25.58 
 
 
447 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  25.58 
 
 
447 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  27.13 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  26.02 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  25.08 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  27.31 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  28.34 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2569  response regulator receiver protein  27.49 
 
 
524 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220458  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  27.94 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  26.09 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  27.94 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  24.32 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.71 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  27.71 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  27.71 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  26.18 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  27.71 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  25.77 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  25.32 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03531  putative septum site-determining protein MinD  26.58 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  22.29 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  23.35 
 
 
481 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  26.25 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  26.25 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  26.25 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  26.25 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  26.25 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  26.25 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  26.25 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  30.16 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  30.16 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  24.43 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  28.47 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  25.95 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.21 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  25.62 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03451  putative septum site-determining protein MinD  25.1 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2185  septum site-determining protein MinD  26.57 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000542736  unclonable  0.00000174808 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0327  putative septum site-determining protein MinD  25.32 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>