More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3423 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  100 
 
 		 407 aa  778    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  48.79 
 
 		 401 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  50.35 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  49.13 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  47.71 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.88 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  36.25 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.96 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  35.27 
 
 		 397 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  27.76 
 
 		 389 aa  103  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  28.51 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  35.53 
 
 		 444 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  28.63 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  26.21 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  28.34 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  36.81 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  27.45 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  31.84 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  32.43 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  31.25 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  30.51 
 
 		 400 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  30.32 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.72 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  31.93 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  26.33 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  29.83 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  32.09 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  31.54 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  25.41 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.1 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  26.27 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  29.08 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  26.76 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  25.77 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.71 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0721  chromosome partitioning ATPase  27.19 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.76 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  34.51 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  26.76 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  25.19 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.33 
 
 		 293 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  26.7 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  26.7 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  26.85 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.58 
 
 		 278 aa  67  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  29.36 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  32.13 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  25.39 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  25.33 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  27.63 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.1 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.53 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  38.75 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3334  septum site-determining protein MinD  36.3 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0234044  normal  0.602718 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.3 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.91 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  29.93 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1436  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  21.9 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  24.89 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  28.57 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.76 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.83 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0035  septum site-determining protein MinD  33.33 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.253423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.41 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.41 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  27.12 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.34 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1935  septum site-determining protein MinD  32.88 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.1 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2577  septum site-determining protein MinD  32.65 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.28 
 
 		 262 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  34.57 
 
 		 710 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  29.45 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  29.45 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.22 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1736  septum site-determining protein MinD  31.97 
 
 		 269 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1633  septum site-determining protein MinD  32.65 
 
 		 272 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.83 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>