More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5323 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  100 
 
 		 400 aa  812    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  63.75 
 
 		 400 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  56.5 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  56.75 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  46.13 
 
 		 397 aa  315  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  44.64 
 
 		 397 aa  295  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  37.56 
 
 		 402 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  39.6 
 
 		 402 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  39.6 
 
 		 402 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  39.6 
 
 		 402 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  37.89 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  39.31 
 
 		 402 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 397 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  36.63 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  36.88 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  36.88 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  36.63 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  39.07 
 
 		 402 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  38.82 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  34.22 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  31.5 
 
 		 391 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.25 
 
 		 381 aa  146  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.76 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  28.19 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  24.84 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.98 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  27.65 
 
 		 430 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  23.92 
 
 		 373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  25.74 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.8 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.61 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  23.98 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.57 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  23.84 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  23.49 
 
 		 406 aa  96.3  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  24.23 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  26.64 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  24.81 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  23.77 
 
 		 417 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.32 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  23.99 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.46 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.78 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  24.09 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  23.68 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  21.91 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.29 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  24.65 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.12 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  26.11 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  22.59 
 
 		 587 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  26.53 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  21.3 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  25 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  25.09 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  23.62 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  20.21 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.29 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  22.85 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  22.89 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.25 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  22.16 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  25.15 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.31 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  26.14 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  25.28 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  19.23 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  28.42 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  23.89 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  26.71 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  25.82 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  21.43 
 
 		 580 aa  66.6  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  24.24 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  21.63 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.49 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  22.64 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  20.7 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  21.41 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  25.59 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  24.06 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1383  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.02 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  26.67 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  25.37 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  21.26 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.32 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  22.9 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  22.12 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  23.12 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.74 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.3 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.2 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  21.89 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  22.66 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>