More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1273 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  92.09 
 
 		 430 aa  812    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  100 
 
 		 430 aa  870    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  64.51 
 
 		 416 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  63.94 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  37.83 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 392 aa  269  7e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  37.37 
 
 		 391 aa  216  9e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 420 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  32.91 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  30.81 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  29.53 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  34.27 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  28.42 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  28.25 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.65 
 
 		 398 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  31.81 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.44 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  28.88 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  30.67 
 
 		 397 aa  143  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  27.79 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  27.03 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  27.76 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 373 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  24.16 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  26.2 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.67 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.65 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  25.26 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  26.71 
 
 		 389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  29.04 
 
 		 400 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  27.32 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.81 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  25.74 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  26.98 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.94 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 209 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  25.53 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 224 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  26.02 
 
 		 413 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  28.79 
 
 		 537 aa  106  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  25.73 
 
 		 397 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  25.08 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 201 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  24.7 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  25.23 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.38 
 
 		 205 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  42.76 
 
 		 234 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 216 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.59 
 
 		 201 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 211 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 212 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 216 aa  99.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 237 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 237 aa  99  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 225 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.67 
 
 		 216 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.54 
 
 		 204 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.32 
 
 		 204 aa  97.8  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 216 aa  96.7  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 216 aa  96.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 234 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 197 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 239 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  42.02 
 
 		 201 aa  96.3  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.29 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 216 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 223 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 217 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  32.2 
 
 		 214 aa  95.1  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 214 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 226 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4533  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 151 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.59 
 
 		 217 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  23.4 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.5 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  26.4 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  26.45 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 216 aa  94.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  42.74 
 
 		 216 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.17 
 
 		 382 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  26.4 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  26.49 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  40.98 
 
 		 212 aa  93.6  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 232 aa  93.6  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 238 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  23.42 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.86 
 
 		 222 aa  92.8  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 222 aa  93.2  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 233 aa  92.8  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.83 
 
 		 217 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  41.38 
 
 		 217 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 225 aa  92.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.74 
 
 		 221 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 		 214 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>