202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0235 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  100 
 
 		 437 aa  893    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  61.38 
 
 		 493 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  56.2 
 
 		 528 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  52.35 
 
 		 422 aa  455  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  54.74 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  50.84 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  51.8 
 
 		 423 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  49.4 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  50.88 
 
 		 421 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  51.19 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  51.04 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  51.01 
 
 		 422 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  55.26 
 
 		 414 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  49.27 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  50.78 
 
 		 425 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  52.25 
 
 		 414 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  50.37 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  52.24 
 
 		 414 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  50.5 
 
 		 414 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  49.08 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  50.5 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  51.55 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  48.51 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  48.61 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  47.49 
 
 		 580 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  44.72 
 
 		 587 aa  345  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  29.78 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  27.3 
 
 		 424 aa  153  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  31.37 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  28.65 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  30.81 
 
 		 411 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  30.81 
 
 		 411 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  30.81 
 
 		 411 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  30.81 
 
 		 411 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  30.81 
 
 		 411 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  30.81 
 
 		 411 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  26.86 
 
 		 407 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  26.86 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  28.09 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  29.56 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.72 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  25.47 
 
 		 415 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  27.76 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  29.64 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.48 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  28.09 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  27.24 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 401 aa  99.8  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  27.76 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  25.45 
 
 		 397 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  24.67 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.37 
 
 		 391 aa  89.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  23.93 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  25.41 
 
 		 383 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.59 
 
 		 381 aa  86.7  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.67 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  21.97 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  23.39 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  22.97 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.25 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  27.65 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.34 
 
 		 381 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  24.85 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  23.56 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.56 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  27.65 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  26.36 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  23.56 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  23.56 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  23.46 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  22.52 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  25.27 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  22.8 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  21.79 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  26.94 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  25.73 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  23.69 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  24.42 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  23.84 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  24 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  24.84 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  24.41 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  24.07 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  24.71 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  24.01 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  22.77 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.81 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  24.01 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.69 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  22.71 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.45 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  22.02 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  26.67 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  28.4 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  21.4 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0897  response regulator receiver protein  26.68 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.7 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  24.59 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>