232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3423 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  85.5 
 
 		 415 aa  718    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  98.53 
 
 		 407 aa  811    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  100 
 
 		 407 aa  820    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  54.48 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  52.21 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  52.21 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  52.21 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  52.21 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  52.21 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  52.21 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  33.95 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  30.53 
 
 		 400 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  30.73 
 
 		 422 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  29.79 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  33.55 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 422 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  31.76 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  27.71 
 
 		 580 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  29.93 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  27.3 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  27.95 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  29.49 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  28.25 
 
 		 425 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  27.86 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  27.84 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  27.7 
 
 		 423 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.75 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  29.64 
 
 		 587 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  27.32 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  29.18 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0897  response regulator receiver protein  31.47 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  27.45 
 
 		 414 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  27.34 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  27.34 
 
 		 414 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  26.86 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  26.68 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  25.97 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  25.68 
 
 		 421 aa  104  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  28.4 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  26.78 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  26.05 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  28.49 
 
 		 493 aa  95.5  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  26.62 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 425 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  25.9 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  23.75 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  21.61 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  28.27 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  27.18 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  22.63 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  26.46 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  21.43 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  23.05 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  27.2 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  24.77 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.37 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  23.85 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.98 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  25.27 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  24.32 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  26.37 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  25.25 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  25.99 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  24.93 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  20.46 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  21.94 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  26.7 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  25.19 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0371  type II secretion system protein Z  22.48 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  24.78 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  26.92 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  26.92 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  26.92 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  29.27 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  22.75 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  25.16 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  29.38 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.98 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.43 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  22.83 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.25 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  19.86 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  26.41 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  27.64 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  23.25 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  27.11 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  26.41 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.82 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  23.11 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.76 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  23.21 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  23.63 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  24.15 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  25.45 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>