159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2044 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  100 
 
 		 401 aa  795    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  70.18 
 
 		 399 aa  552  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0897  response regulator receiver protein  68.42 
 
 		 399 aa  511  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  44.53 
 
 		 414 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  30.94 
 
 		 424 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  32.16 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  32.25 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  33.43 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  29.82 
 
 		 400 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 407 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  32.12 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  32.12 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  32.12 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  32.12 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  32.12 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  32.12 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  29.61 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  29.77 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 389 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.06 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  28.49 
 
 		 425 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  28.57 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  29.11 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  27.73 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  29.67 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  26.91 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  27.72 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  27.09 
 
 		 422 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  28.27 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  28.8 
 
 		 528 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  28.27 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  28.88 
 
 		 414 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 587 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  28.88 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  27.66 
 
 		 422 aa  106  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  29.48 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  29.3 
 
 		 428 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  27.74 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  27.25 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  26.45 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  26.22 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  30.65 
 
 		 580 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  26.65 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  25.07 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  26.47 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  24.52 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  25.94 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.66 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  23.1 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  22.27 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.81 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  21.56 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  23.75 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  28.52 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  26.07 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  23.91 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  28.67 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  28.67 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  26.44 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  26.44 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  26.44 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  26.16 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  26.14 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  23.69 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  24.78 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  23.6 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  23.99 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  25.98 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  25.98 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0607  hypothetical protein  23.72 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  25.98 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  25.98 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  25.84 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.63 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  21.79 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  25.98 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  25.98 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  25.98 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  26.01 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.99 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.57 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  29.01 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  23.89 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.96 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  25.96 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  24.66 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  25.34 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0520  septum site-determining protein MinD  29.28 
 
 		 265 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172258 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0371  type II secretion system protein Z  22.39 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.93 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  27.03 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06194  hypothetical protein  22.22 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  23.67 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>