121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0371 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0371  type II secretion system protein Z  100 
 
 
405 aa  823    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10044  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06194  hypothetical protein  33.9 
 
 
413 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03351  hypothetical protein  32.61 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0607  hypothetical protein  32.3 
 
 
411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  23.74 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  25.08 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  24.33 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  24.33 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  24.33 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  24.33 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  24.33 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  24.33 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  23.1 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  23.05 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  24.42 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  23.13 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  22.48 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0259  hypothetical protein  22.6 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000795988  decreased coverage  0.0000000225048 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  22.48 
 
 
407 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  22.77 
 
 
422 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0600  hypothetical protein  21.92 
 
 
375 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261467  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  23.48 
 
 
422 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0683  hypothetical protein  21.92 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  21.83 
 
 
414 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  21.21 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  21.88 
 
 
422 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  25.17 
 
 
528 aa  60.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  22.04 
 
 
414 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  21.39 
 
 
580 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  22.04 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  22.41 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  23.5 
 
 
463 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  26.28 
 
 
270 aa  57  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  22.28 
 
 
399 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  20.69 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  22.39 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  22.1 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  22.94 
 
 
397 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  30.11 
 
 
412 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1809  septum site-determining protein MinD  24.73 
 
 
270 aa  53.1  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0710931  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  22.31 
 
 
493 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  22.5 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  21.98 
 
 
428 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  20 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2091  septum site-determining protein MinD  24.36 
 
 
270 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  23.28 
 
 
273 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1055  septum site-determining protein MinD  25.98 
 
 
271 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  24.02 
 
 
265 aa  51.2  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  20.44 
 
 
425 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  21.43 
 
 
455 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  22.41 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3424  septum site-determining protein MinD  25.62 
 
 
271 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  21.67 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  23.75 
 
 
422 aa  50.1  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  21.39 
 
 
422 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  23.79 
 
 
264 aa  50.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0656  septum site-determining protein MinD  25.62 
 
 
271 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.676446  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  24.64 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  21.49 
 
 
400 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.91 
 
 
381 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0844  septum site-determining protein MinD  24.91 
 
 
271 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142059  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  24.46 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  21.21 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  23.24 
 
 
587 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  21.05 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0856  septum site-determining protein MinD  24.91 
 
 
271 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.866875  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  24.38 
 
 
289 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  24.38 
 
 
289 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  20.78 
 
 
421 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3507  cell division inhibitor  26.67 
 
 
271 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00615597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1820  septum site-determining protein MinD  27 
 
 
266 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0125  septum site-determining protein MinD  24.91 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  22.69 
 
 
266 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  23.2 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0276  septum site-determining protein MinD  25.27 
 
 
271 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0505  septum site-determining protein MinD  24.55 
 
 
271 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.978735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0008  septum site-determining protein MinD  23.19 
 
 
271 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0984  septum site-determining protein MinD  24.55 
 
 
271 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0944  septum site-determining protein MinD  24.55 
 
 
271 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  26.28 
 
 
392 aa  47  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2112  septum site-determining protein MinD  24.19 
 
 
271 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300985  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3066  septum site-determining protein MinD  24.19 
 
 
271 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  25.12 
 
 
414 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0800  septum site-determining protein MinD  24.19 
 
 
271 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2632  septum site-determining protein MinD  24.19 
 
 
271 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2967  septum site-determining protein MinD  24.19 
 
 
271 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3032  septum site-determining protein MinD  24.19 
 
 
271 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31894  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1980  septum site-determining protein MinD  24.19 
 
 
271 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  22.88 
 
 
373 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0322  septum site-determining protein MinD  27.59 
 
 
271 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0928879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1935  septum site-determining protein MinD  24.36 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0542  septum site-determining protein MinD  22.31 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000432714  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6587  septum site-determining protein MinD  28.07 
 
 
272 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  23.61 
 
 
666 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2971  septum site-determining protein MinD  26.78 
 
 
271 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2415  septum site-determining protein MinD  24.19 
 
 
271 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  24.31 
 
 
264 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5651  septum site-determining protein MinD  28.07 
 
 
271 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531855  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4088  septum site-determining protein MinD  24.55 
 
 
271 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210489  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  24.35 
 
 
405 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>