43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0607 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0607  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  847    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06194  hypothetical protein  46.98 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03351  hypothetical protein  42.16 
 
 		 411 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0371  type II secretion system protein Z  32.3 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  23.72 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0683  hypothetical protein  22.47 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  23.78 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0600  hypothetical protein  20.43 
 
 		 375 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261467  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0259  hypothetical protein  20.12 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000795988  decreased coverage  0.0000000225048 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  27.84 
 
 		 270 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 493 aa  50.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2971  septum site-determining protein MinD  27.14 
 
 		 271 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  25.54 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  26.43 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2091  septum site-determining protein MinD  27.61 
 
 		 270 aa  46.6  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  22.5 
 
 		 364 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 397 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  23.45 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  26.49 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3026  septum site-determining protein MinD  25 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169387  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1809  septum site-determining protein MinD  26.67 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0710931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  24.64 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  22.86 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  24.86 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0633  septum site-determining protein MinD  26.94 
 
 		 271 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  23.83 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4341  septum site-determining protein MinD  27.65 
 
 		 271 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.243396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  25.73 
 
 		 343 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  20.79 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  26.54 
 
 		 269 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  25.36 
 
 		 269 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000153952  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  24.66 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.67 
 
 		 274 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  24.31 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  26.54 
 
 		 269 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  24.31 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  27.5 
 
 		 357 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  21.78 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  25.11 
 
 		 528 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1764  septum site-determining protein MinD  25.36 
 
 		 269 aa  43.1  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000145291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>