211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02980 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
343 aa  691    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  73.49 
 
 
495 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  65.36 
 
 
388 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  65.36 
 
 
388 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  65.36 
 
 
388 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  62.8 
 
 
362 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  67 
 
 
364 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  63.95 
 
 
405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  63.25 
 
 
639 aa  378  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  57.71 
 
 
899 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  60.95 
 
 
665 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  61 
 
 
418 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  58.36 
 
 
698 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  55.84 
 
 
478 aa  353  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  61.19 
 
 
619 aa  345  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  52.12 
 
 
771 aa  322  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  55.82 
 
 
330 aa  315  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  52.88 
 
 
759 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  46.94 
 
 
346 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  41.38 
 
 
463 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  41.38 
 
 
455 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  41.5 
 
 
412 aa  219  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  37.74 
 
 
453 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  37.79 
 
 
416 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  41.03 
 
 
475 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  41.03 
 
 
475 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  41.03 
 
 
475 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  39.12 
 
 
666 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  37.95 
 
 
425 aa  195  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  37.26 
 
 
587 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  33.62 
 
 
414 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.62 
 
 
552 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  35.44 
 
 
1132 aa  165  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  37.73 
 
 
1160 aa  155  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  35.27 
 
 
319 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  35.27 
 
 
319 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  35.27 
 
 
319 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  34.38 
 
 
390 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  35.03 
 
 
341 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  36.47 
 
 
1519 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  35.17 
 
 
380 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.45 
 
 
532 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  30.85 
 
 
390 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  32.18 
 
 
926 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  33 
 
 
968 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  33.09 
 
 
617 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  32.72 
 
 
586 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  33.33 
 
 
534 aa  133  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  32.35 
 
 
533 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.85 
 
 
542 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  30.95 
 
 
544 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  36 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  30.07 
 
 
811 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  33.45 
 
 
439 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  33.33 
 
 
474 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  32.94 
 
 
487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  30.45 
 
 
579 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  29.5 
 
 
478 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  29.19 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  28.57 
 
 
485 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  25.09 
 
 
494 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  27.39 
 
 
659 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  26.19 
 
 
417 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  26.74 
 
 
397 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21891  putative septum site-determining protein MinD  27.72 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.23 
 
 
288 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0779  chromosome partitioning ATPase  28.4 
 
 
431 aa  56.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000669652  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  25.37 
 
 
400 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.59 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  24.59 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  27.83 
 
 
420 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.81 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  26.67 
 
 
397 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.35 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  26.63 
 
 
402 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03571  putative septum site-determining protein MinD  26.63 
 
 
271 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.377857  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  27.09 
 
 
400 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
251 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.69 
 
 
278 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.7 
 
 
258 aa  52.8  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  33.58 
 
 
290 aa  52.8  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  20.61 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04100  hypothetical protein  26.53 
 
 
290 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0820213  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1853  septum site-determining protein MinD  29.41 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0734838  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0481  septum site-determining protein MinD  27.27 
 
 
270 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.747838  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.33 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.33 
 
 
303 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  26.2 
 
 
390 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04131  putative septum site-determining protein MinD  26.09 
 
 
271 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0953852  normal  0.420174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1726  hypothetical protein  25.12 
 
 
550 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0145734  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  23.22 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.19 
 
 
296 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.19 
 
 
296 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  26.96 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.88 
 
 
423 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.83 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0607  hypothetical protein  25.73 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.15 
 
 
414 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4616  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.35 
 
 
312 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146651  normal  0.902168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  26.57 
 
 
544 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>