54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06194 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06194  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  852    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03351  hypothetical protein  56.9 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0607  hypothetical protein  46.98 
 
 		 411 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0371  type II secretion system protein Z  33.9 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10044  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0259  hypothetical protein  20.61 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000795988  decreased coverage  0.0000000225048 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0600  hypothetical protein  20.61 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261467  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  23.54 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0683  hypothetical protein  20.61 
 
 		 375 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  27.04 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  22.38 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  22.22 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  23.76 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0378  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.22 
 
 		 276 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  24 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  24.58 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.02 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0368  ParaA family ATPase  25.09 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  23.46 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.72 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  23.27 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  22.3 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  22.3 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  21.84 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.42 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00471356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  27.89 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.18 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0366  histidinol phosphatase  27.27 
 
 		 288 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00129205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  23.42 
 
 		 580 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.66 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  21.36 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  28.21 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  24.68 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.4 
 
 		 276 aa  44.3  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  30.19 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  24.63 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1364  septum site-determining protein MinD  25.44 
 
 		 271 aa  43.9  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.63 
 
 		 289 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  23.72 
 
 		 260 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.6 
 
 		 308 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  29.47 
 
 		 290 aa  43.9  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  25.26 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.33 
 
 		 370 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  24.2 
 
 		 287 aa  43.5  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  22.97 
 
 		 270 aa  43.5  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  23.93 
 
 		 269 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  28.18 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 296 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  22.34 
 
 		 265 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  22.34 
 
 		 265 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  25.77 
 
 		 285 aa  43.1  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2353  septum site-determining protein MinD  24.54 
 
 		 277 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.013257  normal  0.155337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  27.21 
 
 		 422 aa  43.1  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.92 
 
 		 310 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>