178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4866 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  100 
 
 		 422 aa  858    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  55.29 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  58.51 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  31.32 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 389 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  30.61 
 
 		 422 aa  172  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  30.38 
 
 		 414 aa  169  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  30.9 
 
 		 528 aa  166  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  30.19 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  30.33 
 
 		 423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  29.54 
 
 		 425 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  30.79 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  31.4 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  29.3 
 
 		 414 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  28.53 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  31.1 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  29.92 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  29.11 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  30.08 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  29.71 
 
 		 421 aa  154  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  29.79 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  31.92 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  32.16 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  29.36 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  28.53 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  29.78 
 
 		 437 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  28.41 
 
 		 580 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  28.95 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  28.95 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  28.95 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  28.95 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  28.95 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  28.95 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  29.83 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  29.02 
 
 		 428 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  29.65 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  29.11 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  31.02 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  29.68 
 
 		 493 aa  133  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  29.41 
 
 		 415 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  29.65 
 
 		 425 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 587 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.35 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  26.46 
 
 		 413 aa  119  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0897  response regulator receiver protein  27.49 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  22.93 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  22.74 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  21.04 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  25.08 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  23.86 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  23.28 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  23.93 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  25.98 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  21.63 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  25.06 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  25 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  25.81 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  21.54 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  21.85 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  22.49 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.12 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  26.38 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.54 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  23.03 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.03 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  23.82 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4398  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  23.4 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  24.33 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.99 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  24.79 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  24.36 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  23.66 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  20.85 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0371  type II secretion system protein Z  22.77 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10044  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  24.22 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  25.31 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  22.61 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  29.65 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  22.19 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.86 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  26.29 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  26.29 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  24.71 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.07 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.4 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.36 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.87 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  26.22 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  26.22 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  27.69 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  25.15 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  25.15 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  26.22 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  26.22 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  26.22 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>