182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0820 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  100 
 
 		 403 aa  799    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  34.22 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  35.01 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  31.25 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  34.54 
 
 		 405 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  30.94 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  30.94 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  30.94 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  30.94 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  30.94 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  30.94 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  30.75 
 
 		 389 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  28.03 
 
 		 424 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  30.27 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  29.14 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  28.31 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  28.74 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  28.39 
 
 		 423 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  27.99 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  27.9 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  27.76 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  30 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  27.6 
 
 		 493 aa  97.8  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  28.79 
 
 		 421 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  28.53 
 
 		 422 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  29.29 
 
 		 528 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  27.92 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  29.65 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  29.65 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  29.7 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  26.96 
 
 		 423 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 587 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  25.64 
 
 		 580 aa  88.2  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  30.32 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  27.62 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  33.77 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  26.78 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  26.8 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0897  response regulator receiver protein  30.92 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  26.1 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  23.14 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  24.22 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  25.14 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  25.07 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  26.59 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  26.59 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  27.03 
 
 		 537 aa  66.2  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  27.89 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  29.8 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  20.65 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  23.42 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  24.7 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  24.6 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  23.2 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  21.2 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  22.8 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  23.15 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  23.29 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  23.36 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  20.76 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  26.37 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.63 
 
 		 314 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  24.12 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  23.6 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.36 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  26.2 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  26.2 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25.44 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  24.43 
 
 		 265 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  25 
 
 		 266 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000107586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  22.83 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3026  septum site-determining protein MinD  25.79 
 
 		 272 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  23.86 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  25 
 
 		 275 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  22.03 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  22.48 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  29.52 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.74 
 
 		 259 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.74 
 
 		 259 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2569  response regulator receiver protein  26.77 
 
 		 524 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  27.41 
 
 		 265 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  28.06 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  20.99 
 
 		 269 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  22.91 
 
 		 273 aa  47  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0502  septum site-determining protein MinD  27.78 
 
 		 271 aa  47  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0531405 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.35 
 
 		 262 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0520  septum site-determining protein MinD  25.79 
 
 		 265 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172258 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  27.5 
 
 		 400 aa  46.6  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  23.78 
 
 		 265 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  23.78 
 
 		 265 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  20.67 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.94 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1996  cell division inhibitor MinD  25.15 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>