More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0608 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  60.54 
 
 		 587 aa  693    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  100 
 
 		 580 aa  1182    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  47.51 
 
 		 423 aa  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  44.22 
 
 		 422 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  47.49 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  45.71 
 
 		 528 aa  356  6.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  41.71 
 
 		 414 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 414 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  41.73 
 
 		 423 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  42.68 
 
 		 421 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  42.68 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  40.61 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  41.84 
 
 		 422 aa  343  4e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  41.92 
 
 		 423 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  42.64 
 
 		 428 aa  339  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  43.17 
 
 		 414 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  42.93 
 
 		 414 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  40.73 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 414 aa  335  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  43.65 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  40.82 
 
 		 422 aa  333  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  42.21 
 
 		 414 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  41.11 
 
 		 428 aa  324  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  40.4 
 
 		 425 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  37.93 
 
 		 422 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  40.79 
 
 		 425 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  27.2 
 
 		 424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  28.77 
 
 		 405 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  28.19 
 
 		 411 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  28.19 
 
 		 411 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  28.19 
 
 		 411 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  28.19 
 
 		 411 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  28.19 
 
 		 411 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  28.19 
 
 		 411 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  26.77 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  27.71 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  27.93 
 
 		 400 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 407 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.13 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  26.17 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 420 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25.08 
 
 		 406 aa  101  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  25.89 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  25.16 
 
 		 397 aa  97.8  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.87 
 
 		 377 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  23.75 
 
 		 392 aa  94.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 401 aa  94.4  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  23.39 
 
 		 444 aa  94  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.28 
 
 		 381 aa  92  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  25.93 
 
 		 387 aa  90.1  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  24.8 
 
 		 413 aa  87.4  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 402 aa  87.4  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.07 
 
 		 397 aa  87  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.61 
 
 		 400 aa  86.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  21.47 
 
 		 419 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  26.28 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  25.39 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.9 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  25.39 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  21.74 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  25.64 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  26.04 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  28.74 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  28.74 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  28.74 
 
 		 265 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  28.74 
 
 		 265 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  28.74 
 
 		 265 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4193  septum site-determining protein; cell division inhibitor  28.74 
 
 		 265 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  25.27 
 
 		 383 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4528  septum site-determining protein MinD  28.74 
 
 		 265 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4582  septum site-determining protein MinD  28.74 
 
 		 265 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  28.74 
 
 		 265 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  28.74 
 
 		 265 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  20.29 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  28.35 
 
 		 265 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  25.54 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  25.54 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  27.95 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  26.52 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  21.69 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  22.06 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.63 
 
 		 381 aa  80.1  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  25.27 
 
 		 402 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  23.34 
 
 		 400 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.88 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  25.46 
 
 		 402 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  23.72 
 
 		 390 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3409  septum site-determining protein MinD  27.17 
 
 		 270 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  23.75 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.56 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  21.92 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.48 
 
 		 389 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0542  septum site-determining protein MinD  26.53 
 
 		 263 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000432714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  25.59 
 
 		 265 aa  76.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  24.56 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  21.93 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  27.56 
 
 		 266 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>