214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1678 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  100 
 
 
411 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  93.58 
 
 
405 aa  734    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  100 
 
 
411 aa  798    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  100 
 
 
411 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  100 
 
 
411 aa  798    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  100 
 
 
411 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  100 
 
 
411 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  53.33 
 
 
415 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  53.91 
 
 
407 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  53.12 
 
 
407 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  30.91 
 
 
400 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  34.21 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  29.94 
 
 
424 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  30.86 
 
 
422 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  33.7 
 
 
528 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  29.49 
 
 
422 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  32.43 
 
 
401 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  31.33 
 
 
399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  30.11 
 
 
413 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.52 
 
 
400 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  32.28 
 
 
493 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  28.19 
 
 
580 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  31.07 
 
 
587 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  28.14 
 
 
422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  31.02 
 
 
403 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  31.55 
 
 
428 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  29.61 
 
 
428 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  31.07 
 
 
414 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  31.13 
 
 
437 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  29.29 
 
 
414 aa  123  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  31.72 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0897  response regulator receiver protein  30.55 
 
 
399 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  28.89 
 
 
428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  30.06 
 
 
414 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  27.76 
 
 
425 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  27.76 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  27.76 
 
 
423 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  28.53 
 
 
425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  28.62 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  30.55 
 
 
414 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  30.62 
 
 
414 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  30.55 
 
 
414 aa  113  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  26.9 
 
 
423 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  25.75 
 
 
414 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  26.24 
 
 
425 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  26.5 
 
 
421 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  25.45 
 
 
425 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  25.93 
 
 
422 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  26.09 
 
 
391 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  21.9 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0371  type II secretion system protein Z  24.33 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.25 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  24.06 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  26.07 
 
 
537 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  24.31 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  22.98 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  25.8 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  23.36 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  20.85 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  25.95 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.19 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  24.91 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  24.91 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  24.94 
 
 
387 aa  67  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  22.9 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.41 
 
 
377 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  32.84 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  26.07 
 
 
447 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  26.07 
 
 
447 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  26.52 
 
 
373 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.67 
 
 
389 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4398  response regulator receiver protein  24.37 
 
 
380 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  23.46 
 
 
389 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  21.97 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  25.32 
 
 
420 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  23.86 
 
 
430 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  28.05 
 
 
416 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  25.33 
 
 
396 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  23.05 
 
 
414 aa  60.1  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  25.47 
 
 
400 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.64 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  21.4 
 
 
414 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  25.44 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  26.94 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  27.95 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  24.92 
 
 
435 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  24.85 
 
 
439 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  23.94 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  23.62 
 
 
424 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  30.61 
 
 
400 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  27.76 
 
 
412 aa  57  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  25.57 
 
 
423 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.4 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.8 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  27.86 
 
 
394 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  27.53 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  24.08 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  29.12 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  24.67 
 
 
396 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  29.12 
 
 
373 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>