178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4359 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  83.22 
 
 		 439 aa  737    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  100 
 
 		 447 aa  887    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  100 
 
 		 447 aa  887    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  54.99 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  53 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  46.3 
 
 		 413 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  42.82 
 
 		 412 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  42.32 
 
 		 412 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  42.32 
 
 		 412 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  42.32 
 
 		 412 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  42.32 
 
 		 412 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  42.32 
 
 		 412 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  42.32 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  42.32 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  41.26 
 
 		 424 aa  282  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  41.87 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  42.82 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  44.03 
 
 		 412 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  44.03 
 
 		 412 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  44.03 
 
 		 412 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  41.33 
 
 		 427 aa  280  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  42.4 
 
 		 412 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  40.59 
 
 		 424 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  34.81 
 
 		 508 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  34.63 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2325  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  34.31 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.571647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  30.47 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2703  pilus assembly protein CpaE, putative  34.31 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711069  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  29.65 
 
 		 418 aa  143  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  27.75 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  30.21 
 
 		 394 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  30.21 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  26.32 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  26.13 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  25.33 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  29.45 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  22.5 
 
 		 373 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.46 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  25.51 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  25 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  22.97 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  24.76 
 
 		 392 aa  97.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0071  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 397 aa  97.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  25.08 
 
 		 416 aa  94  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  26.58 
 
 		 425 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  24.1 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.72 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  23.35 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  26.61 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  25.85 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  25.99 
 
 		 422 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  26.3 
 
 		 423 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  25.97 
 
 		 423 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.46 
 
 		 389 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.13 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  26.03 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  27.1 
 
 		 422 aa  89  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  25.91 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  26.2 
 
 		 421 aa  87  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  27.3 
 
 		 422 aa  86.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.99 
 
 		 399 aa  86.7  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.58 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  22.45 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  23.65 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.79 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  25.35 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  24.4 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  27.7 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  25.34 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.84 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.22 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.38 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  26.14 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  24.42 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  24.52 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  22.68 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  28.09 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3513  response regulator receiver protein  26.82 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  23.39 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  22.33 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  22.16 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  24.12 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  22.36 
 
 		 373 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  21.67 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  22.9 
 
 		 580 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  24.44 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  25.97 
 
 		 397 aa  67  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  22.67 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  26.24 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  24.32 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  22.38 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  22.22 
 
 		 528 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  22.38 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.81 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.46 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  25.71 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  25.71 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  25.71 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>