160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1127 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1127  response regulator receiver protein  100 
 
 		 422 aa  859    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.207281  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1077  response regulator receiver domain-containing protein  59.37 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  58.51 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1514  putative response regulator receiver  34.66 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2691  response regulator receiver protein  34.05 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 414 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  30.95 
 
 		 528 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  30.87 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  32.95 
 
 		 414 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  31.41 
 
 		 425 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  32.78 
 
 		 422 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  30.79 
 
 		 414 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  32.67 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  29.38 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  30.16 
 
 		 423 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  31.99 
 
 		 421 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  30.55 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  30.86 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  30.35 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  30.86 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  30.86 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  30.86 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  30.86 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  30.86 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  31.47 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  30.73 
 
 		 407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  33.43 
 
 		 401 aa  161  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  32.27 
 
 		 414 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 407 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  28.39 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  30.49 
 
 		 423 aa  153  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  28.01 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  28.8 
 
 		 580 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  31.44 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  28.61 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  28.86 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  28.53 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  28.72 
 
 		 428 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  28.65 
 
 		 437 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 587 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3489  putative pilus assembly protein  30.19 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0553969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0669  response regulator receiver protein  31.66 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.19 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  25.6 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  26.44 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  29.14 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0897  response regulator receiver protein  31.35 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  22.66 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  27.44 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  27.44 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  20.91 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  23.91 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  20.55 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.82 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  26.13 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0371  type II secretion system protein Z  23.75 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  21.52 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  25.54 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  24.41 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  25.54 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  23.7 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  23.17 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.78 
 
 		 389 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  25 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  25 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  25 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  29.49 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  23.44 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  21.14 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  24.55 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  20.75 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  22.16 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  24.5 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  24.69 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  24.76 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  24.44 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  24.44 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  24.44 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  24.44 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  24.44 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  21.75 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  25.17 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  24.44 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  24.44 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  21.53 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  22.34 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  21.86 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  21.74 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  24.12 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  24.3 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  23.41 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.87 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  22.49 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.99 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  24.63 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  23.41 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  23.41 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  22.88 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>